Genetik kodunun kilidini açması ile atalarının hatıralarına erişebilen Callum Lynch, 15. yüzyıl İspanya'sında yaşayan atası Aguilar'ın maceralarını kendi hafızalarında yer alacak kadar canlı bir şekilde tecrübe edecektir. Gizli bir topluluk olan Suikastçiler'in soyundan geldiğini öğrenen genç adam, yeni kazandığı yetenekler ile baskıcı ve güçlü organizasyon Templer'ın karşısına çıkacaktır. Callum, günümüzde de varolan Templar organizasyonunu alt etmek için geçmişindeki bilgi ve tecrübesini kullanacaktır.